MD ÖZHAN ŞİMŞEK

Metrics

Publication

Publication (WoS)

Publication (Scopus)

Citation (WoS)

195

H-Index (WoS)

Citation (Scopus)

225

H-Index (Scopus)

Project

Open Access

UN Sustainable Development Goals

Education

2009 - 2016

Doctorate

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Turkey

2007 - 2009

Postgraduate

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Turkey

2002 - 2006

Undergraduate

Cukurova University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Turkey

Dissertations

2016

Doctorate

TURUNÇGİLLERDE NÜSELLER EMBRİYONİ MEKANİZMASINDA ETKİN OLAN GENLERİN MOLEKÜLER YÖNTEMLER İLE ARAŞTIRILMASI

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı

2009

Postgraduate

BAZI TURUNÇGİL ANAÇLARINDA DEMİR (Fe) KLOROZUNA DAYANIKLILIKTAN SORUMLU GENLERİN SSCP MARKIRLARIYLA ALLELİK ÇEŞİTLİLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı

Foreign Languages

B2 Upper Intermediate

English

Certificates, Courses and Trainings

2015

Bitki Islahında Mutasyon ve İlgili Biyoteknolojik Teknikler Eğitimi

Education Management and Planning

Türkiye Atom Enerjisi Kurumu, Sarayköy Nükleer Araştırma ve Eğitim Merkezi

2015

Bitki Islahında DNA Markırları, Gen Ekspresyonu ve Mikro RNA Teknolojisi Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2014

Süs Bitkileri Islahı Kursu (Klasik ve Biyoteknolojik Yöntemler)

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2014

Uygulamalı Haploid Bitki Üretimi ve Kromozom Katlaması Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2013

Uygulamalı DNA Markırları ve Bitki Islahında Kullanımı Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2013

Uygulamalı Bitki Doku Kültürleri ve Genetik Mühendisliği Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2012

Nano Teknoloji Temelli Real-Tıme PCR Teknikleri Uygulamalı Kursu

Education Management and Planning

Mersin Üniversitesi, İleri Teknoloji Eğitim, Araş. ve Uyg. Merkezi

2010

Genetik Çalışmalarda Biyoinformatik Uygulamalar

Education Management and Planning

TÜBİTAK MAM

2010

Genetik Kış Okulu

Education Management and Planning

İstanbul Üniversitesi

2008

Uygulamalı RNA Interferance Kursu

Education Management and Planning

Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü

Research Areas

Agricultural Sciences

Agriculture

Garden Plants

Fruit Breeding and Breeding

Biotechnology and Genetics

Research Areas Based on Academic Activities

Avesis Research Areas

WoS Research Areas

Scopus Research Areas

Academic Positions

2016 - Continues

Medical Doctor

Cukurova University, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü

2011 - 2016

Research Assistant

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Bölümü

Managerial Experience

Non Academic Experience

2012 - Continues

Biyolog

Çukurova Üniversitesi/Ziraat Fakültesi, Biyolog

2008 - 2008

State Agency, Ivıa (Valencia Tarımsal Araştırma Enstitüsü), Valencia, İspanya

Courses

Associate Degree

Botanik

Articles

2019

1. Comparative transcriptome sequencing to determine genes related to the nucellar embryony mechanism in citrus

ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., ETİ S., YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y.

TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY , vol.43, no.1, pp.58-68, 2019 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2018

2. Narda (Punica granatum L.) Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi Kullanılarak SSRMarkırlarının Geliştirilmesi

Şimşek Ö., Dönmez D., İMRAK B., ÖZGÜVEN A. I., KAÇAR Y.

International Journal of Agriculture and Wildlife Science (IJAWS) , 2018 (TRDizin)

2018

3. EFFECT OF DROUGHT STRESS IN IN VITRO AND DROUGHT RELATED GENE EXPRESSION IN CARRIZO CITRANGE

ŞİMŞEK Ö.

FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN , vol.27, pp.9167-9171, 2018 (SCI-Expanded)

2017

4. The effects of different explants, basal media and growth regulators on regeneration of carob (Ceratonia siliqua L.)

Curuk P., İzgü T., Şimşek Ö., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., YALÇIN MENDİ N. Y.

JOURNAL OF APPLIED BIOLOGICAL SCIENCES , vol.11, no.3, pp.10-19, 2017 (Peer-Reviewed Journal)

2017

5. Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In Vitro Conditions

ŞİMŞEK Ö., BİÇEN B., DÖNMEZ D., AKA KAÇAR Y.

International Journal of Environmental & Agriculture Research (IJOEAR) , vol.10, pp.54-59, 2017 (Peer-Reviewed Journal)

2017

6. In Vitro Culture of Turkish Origanum sipyleum L.

SEVİNDİK B., İzgü T., Şimşek Ö., Tütüncü M., Curuk P., Yılmaz Ö., et al.

American Journal of Plant Biology , vol.2, no.3, pp.32-36, 2017 (Peer-Reviewed Journal)

2017

7. An Overview of In Vitro Haploid Plant Production in Citrus

Akgöl M., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., AKA KAÇAR Y.

American Journal of Plant Biology. Special Issue:Plant Molecular Biology and Biotechnology , vol.2, pp.19-23, 2017 (Peer-Reviewed Journal)

2017

8. RNA-Seq Analysis in Fruit Science: A Review

ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., AKA KAÇAR Y.

American Journal of Plant Biology , vol.2, pp.1-7, 2017 (Peer-Reviewed Journal)

2017

9. Molecular Characterization of Cyclamen Species Collected from Different Parts of Turkey by RAPD and SRAP Markers

ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P., ASLAN F., BAYRAMOGLU M., Izgu T., da Silva J. A. T., et al.

BIOCHEMICAL GENETICS , vol.55, no.1, pp.87-102, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

10. Molecular Characterization of Turkish Cactus Pear (Opuntia spp.) by RAPD Markers

Tütüncü M., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., KÜDEN A.

JOURNAL OF THE PROFESSIONAL ASSOCIATION FOR CACTUS DEVELOPMENT , vol.18, pp.65-77, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

11. Genetic Engineering Techniques in Fruit Science

Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.

International Journal of Environmental & Agriculture Research (IJOEAR) , vol.2, no.12, pp.115-128, 2016 (Peer-Reviewed Journal)

2016

12. Bazı Kavun Çeşitlerine NHX-1 Geninin Transformasyonu

İZGÜ T., SEVİNDİK B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

ÇUKUROVA TARIM VE GIDA BİLİMLERİ DERGİSİ , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (TRDizin)

2016

13. Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties

izgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

Çukurova Tarım Gıda Bil. Der. , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)

2016

14. Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties

izgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

Çukurova Tarım Gıda Bil. Der. , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)

2016

15. Development of an efficient regeneration protocol for four Cyclamen species endemic to Turkey

Izgu T., Sevindik B., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A., da Silva J. A. T., et al.

PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE , vol.127, no.1, pp.95-113, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

16. Genetic Characterization of Turkish Snake Melon (Cucumis melo L. subsp melo flexuosus Group) Accessions Revealed by SSR Markers

SOLMAZ İ., Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., SARI N.

BIOCHEMICAL GENETICS , vol.54, no.4, pp.534-543, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2016

17. Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties

İZGÜ T., SEVİNDİK B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

Çukurova Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)

2016

18. Genetic diversity within Turkish watermelon [Citrullus lanatus (Thunb.) Matsumura & Nakai] accessions revealed by SSR and SRAP markers

SOLMAZ İ., AKA KAÇAR Y., SARI N., ŞİMŞEK Ö.

TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY , vol.40, no.3, pp.407-419, 2016 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2016

19. Molecular Characterization of Turkish Cactus Pear (& IT;Opuntia & IT;spp.) by RAPD Markers

TÜTÜNCÜ M., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., Kuden A. B.

JOURNAL OF THE PROFESSIONAL ASSOCIATION FOR CACTUS DEVELOPMENT , vol.18, pp.65-77, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)

2015

20. Yeni Nesil DNA Dizileme Teknolojileri ve Bitkilerde Kullanımı

Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.

Türk Bilimsel Derlemeler Dergisi , no.8, pp.30-37, 2015 (Peer-Reviewed Journal)

2014

21. Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi

YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.

Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.7, no.1, pp.80-85, 2014 (Scopus)

2014

22. Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi

YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.

Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.7, no.1, pp.80-85, 2014 (Scopus)

2014

23. Somatic embryogenesis of Turkish Cyclamen persicum Mill

Kocak M., Izgu T., Sevindik B., Tutuncu M., Curuk P., ŞİMŞEK Ö., et al.

SCIENTIA HORTICULTURAE , vol.172, pp.26-33, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)

2014

24. W.Murcott Mandarin Çeşidinde Anter Kültürü Çalışmaları

YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., Akgül M.

DERİM , vol.31, no.2, pp.37-50, 2014 (SCI-Expanded, TRDizin)

2014

25. W. Murcott mandarin çeşidinde anter kültürü çalışmaları

AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., YEŞİLOĞLU T., Akgöl M.

DERİM , no.31, pp.37-50, 2014 (SCI-Expanded, TRDizin)

2014

26. Genetic relationships of some Citrus genotypes based on the candidate iron chlorosis genes

Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., YEŞİLOĞLU T., OLLITRAULT P.

TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY , vol.38, no.3, pp.340-347, 2014 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2013

27. Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi

YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.

Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.6, no.2, pp.127-132, 2013 (Scopus)

2013

28. Improving New Varieties For Citrus Sectoral Needs

YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., İNCESU M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.

Research Journal of Agricultural Sciences , no.2, pp.127-132, 2013 (Peer-Reviewed Journal)

2013

29. Genetic Transformation in Citrus

Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., Izgu T., Kacar Y. A., Mendi Y. Y.

SCIENTIFIC WORLD JOURNAL , 2013 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

30. Giberellik ASiT(GA3) Uygulamalarının Iris germanica (Süsen)’da Gelişme ve Çiçeklenme Üzerine Etkileri

ÇÜRÜK P., İZGÜ T., KOÇAK M., TÜTÜNCÜ M., TAGİPUR E., ŞİMŞEK Ö., et al.

Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.27, no.1, pp.21-26, 2012 (TRDizin)

2012

31. Genetic diversity among melon accessions (Cucumis melo) from Turkey based on SSR markers

Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., SOLMAZ İ., SARI N., Mendi Y. Y.

GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , vol.11, no.4, pp.4622-4631, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

32. Iris germanica (süsen)'da GA3 uygulamalarının gelişme ve çiçeklenme üzerine etkileri

Özgüven A. I., ÇÜRÜK P., izgü t., koçak m., tütüncü m., Tagipur E., et al.

Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.4, pp.10-13, 2012 (Peer-Reviewed Journal)

2011

33. Relationships among Crataegus accessions sampled from Hatay, Turkey, as assessed by fruit characteristics and RAPD

Serce S., ŞİMŞEK Ö., Toplu C., Kamiloglu O., Caliskan O., Gunduz K., et al.

GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION , vol.58, no.6, pp.933-942, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

2011

34. Bitkilerde Mutasyonların Tespiti İçin Kullanılan Moleküler Yöntemler

ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.

Alatarım , vol.10, no.1, pp.50-56, 2011 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2010

35. Discovery of mutations with TILLING and ECOTILLING in plant genomes

ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A.

SCIENTIFIC RESEARCH AND ESSAYS , vol.5, no.24, pp.3799-3802, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)

2010

36. Genetic characterization of heat tolerant tomato (Solanum lycopersicon) genotypes by SRAP and RAPD markers

Comlekcioglu N., Şimşek Ö., Boncuk M., Aka-Kacar Y.

GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , vol.9, no.4, pp.2263-2274, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)

2009

37. IN VİTRO DOKU KÜLTÜRÜ VE SU KÜLTÜRÜ KOŞULLARINDA MAXMA 14 KİRAZ ANACINA ARTAN DOZLARDA UYGULANAN KADMİYUM’UN BİTKİ BÜYÜMESİ VE KADMİYUM ALIMINA ETKİSİ

ALKAN TORUN A., KAÇAR Y., ÇAKMAK Ö., ŞİMŞEK Ö., ERDEM H., YARDIM P., et al.

HARRAN ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ DERGİSİ , vol.13, no.4, pp.1-11, 2009 (TRDizin)

2009

38. Bazı Turunçgil Anaçlarının SSR Markırları ile Moleküler Tanımlanması

YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., Kamiloğlu M., İncesu M.

Alatarım , vol.8, no.2, pp.8-16, 2009 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2009

39. In vitro Doku Kültürü ve Su Kültürü Koşullarında Maxma 14 Kiraz Anacına Artan Dozlarda Uygulanan Kadmiyum?un Bitki Büyümesi ve Kadmiyum Alımına Etkisi

ALKAN TORUN A., AKA KAÇAR Y., Çakmak O., ŞİMŞEK Ö., Erdem H., Yardım P., et al.

Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.13, no.4, pp.1-11, 2009 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2009

40. Bazı Turunçgil Anaçlarının SSR Markırları ile Moleküler Tanımlanması? Alatarım

AKA KAÇAR Y., YEŞİLOĞLU T., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., İNCESU M., Kamiloğlu M., et al.

Alatarım , no.3, pp.15-22, 2009 (TRDizin)

2009

41. In Vitro Doku Kültürü Ve Su Kültürü Koşullarında Maxma 14 Kiraz Anacına Artan Dozlarda Uygulanan Kadmiyum?un Bitki Büyümesi Ve Kadmiyum Alımına Etkisi

ALKAN TORUN A., Erdem H., Tolay I., Kacar Y. A., Şimşek Ö., Yardım P.

HARRAN ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ DERGİSİ , vol.13, pp.1-11, 2009 (TRDizin)

2008

42. Relationships among myrtle accessions from Turkey as revealed by fruit characteristics and RAPD

Serce S., ŞİMŞEK Ö., Gunduz K., Aka-Kacar Y., ERCİŞLİ S.

ROMANIAN BIOTECHNOLOGICAL LETTERS , vol.13, no.6, pp.4054-4065, 2008 (SCI-Expanded, Scopus)

2008

43. Bazı Meyve türlerinde DNA İzolasyon Etkinliğinin Karşılaştırılması

ŞİMŞEK Ö., Karaat F. E., Serçe S., AKA KAÇAR Y.

DERİM , vol.25, no.1, pp.59-69, 2008 (TRDizin)

2008

44. Molecular and pomological diversity among pomegranate (Punica granatum L.) cultivars in Eastern Mediterranean region of Turkey

Durgac C., Ozgen M., Simsek O., Kacar Y. A., Kiyga Y., Celebi S., et al.

AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY , vol.7, no.9, pp.1294-1301, 2008 (SCI-Expanded, Scopus)

Papers Presented at Peer-Reviewed Scientific Conferences

2019

1. Plant Genome Sequences: Past, Present and Future

ŞİMŞEK Ö.

Plant Science and Technology Congress, 18 - 20 December 2019, (Summary Text)

2018

2. Investigation of Micropropagation Performance of Some Citrus Rootstocks in In Vitro Drought Stress Conditions

ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., AKA KAÇAR Y.

IV. International Agriculture Congress, Nevşehir, Turkey, 5 - 08 July 2018, pp.228, (Summary Text)

2018

3. Cryopreservation of Some Cyclamen Species embryonic callus by vitrification and genetic stability

İZGÜ T., YALÇIN MENDİ N. Y., SEVİNDİK B., KOÇAK M., TÜTÜNCÜ M., ŞİMŞEK Ö.

The Third International Symposium on Plant Cryopreservation, Bangkok, Thailand, 26 - 28 March 2018, (Summary Text)

2017

4. Somatic embryogenesis of some colchicum species

YALÇIN MENDİ N. Y., ÖZKAYA A., SARI M., ÖZDEMİR M. Ş., Sevindik B., Şimşek Ö., et al.

MOLBİOTECH, Afyon, Turkey, 22 - 25 December 2017, pp.51, (Summary Text)

2017

5. Effects of different media on micropropagation and rooting of myrtle (Myrtus communis L.) in in vitro conditions

BICEN B., DÖNMEZ D., ŞİMŞEK Ö., Kacar Y.

European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, vol.256, (Summary Text)

2017

6. Preservation and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods

Izgu T., Sevindik B., TÜTÜNCÜ M., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., et al.

European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, vol.256, (Summary Text)

2017

7. De Novo Assembly and Characterization of the Transcriptome during Seed Development, and Generation of Genic-SSR Markers in Pomegranate (Punica granatum L.)

ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., İMRAK B., Işık Özgüven A., AKA KAÇAR Y.

ICBT 2017 : 19th International Conference on Biotechnology, Barcelona, Spain, 27 - 28 July 2017, vol.4, no.7, pp.589, (Summary Text)

2017

8. Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In vitro Conditions

Biçen B., Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.

European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, pp.10, (Summary Text)

2017

9. Preservatıon and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods

İzgü T., Sevindik B., Tütüncü M., Curuk P., Şimşek Ö., AKA KAÇAR Y., et al.

BEWS, Antalya, Turkey, 3 - 05 April 2017, pp.92, (Summary Text)

2016

10. Evaluation and Comparasion of A New Type of Temporary Immersion System (TIS) Bioreactors for Myrtle (Myrtus communis L.)

ŞİMŞEK Ö., BİÇEN B., DÖNMEZ D., KAÇAR Y.

III International Symposium on Horticulture in Europe, Greece, 17 - 21 October 2016, pp.91, (Summary Text)

2016

11. Bazı Zeytin Çeşitlerinin Çeliklerinin Köklenme Olanaklarının Araştırılması

Tütüncü M., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., ŞİMŞEK Ö., İzgü T., KÜDEN A.

VII. Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Turkey, 25 - 29 August 2016, vol.1, no.3, pp.379-383, (Full Text)

2015

12. Bazı Zeytin Çeşitlerinin Köklenme Olanaklarının Araştırılması

TÜTÜNCÜ M., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., ŞİMŞEK Ö., İZGÜ T., KÜDEN A.

VII. Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 25 August 2015, vol.45, (Full Text)

2015

13. Orta-Geç Yeni Mandarin Çeşitlerinin Melezleme Islahı Yoluyla Geliştirilmesi

YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., ÇİMEN B., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., YILMAZ B., et al.

Ulusal Tarım Kongresi 2015, Afyon, Turkey, 29 - 31 October 2015, vol.1, no.1, pp.37, (Full Text)

2015

14. Nar’da (Punica granatum L.) Yumuşak Sert Çekirdeklilik Oluşum Mekanizmasının Histolojik Yöntemlerle Araştırılması

AKGÖL M., ŞİMŞEK Ö., KARATAŞ N., ETİ S., ÖZGÜVEN A. I., KAÇAR Y.

VII. ULUSAL BAHÇE BİTKİLERİ KONGRESİ, Turkey, 25 - 29 August 2015, (Summary Text)

2015

15. Gou Tou Turuncu X Yerli Üç Yapraklı Melezinin In Vitro Koşullarda Köklenme Olanaklarının Araştırılması

ŞİMŞEK Ö., Bayramoğlu M., Cengiz M., ÇİMEN B., YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y.

7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Turkey, 25 - 29 August 2015, vol.1, no.1, pp.290, (Full Text)

2012

16. Determination of Self-Incompatibility Status of Some Clementine (Citrus clementina) Genotypes by Histological Analysis

Kacar Y., ASLAN F., ETİ S., Boncuk M., ŞİMŞEK Ö., YILDIRIM B., et al.

12th International Citrus Congress - International-Society-of-Citriculture, Valencia, Spain, 18 - 23 November 2012, vol.1065, pp.523-528, (Full Text)

2014

17. Cryopreservation of some endemic Cyclamen species of Turkey by vitrification of embryogenic callus cultures

İzgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P., AKA KAÇAR Y., YALÇIN MENDİ N. Y.

Balkan Agriculture Congress, Edirne, Turkey, 8 - 11 September 2014, pp.705, (Summary Text)

2014

18. Preliminary Results of Determining Nucellar Embryo Initial Cells by Histological Analysis

ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., ETİ S., KARABIYIK Ş., YALÇIN MENDİ N. Y., YEŞİLOĞLU T., et al.

Balkan Agricultural Congress, Tekirdağ, Turkey, 8 - 10 September 2014, pp.1, (Full Text)

2012

19. Research on Transformation Efficiency of Cm-AAT Genes (1,3 and 4) Respons,ible for Aroma Synthesis in Melon (Cucumis melo L., var cantalupensis Naud)

izgü T., Kocaman E., Şimşek Ö., El-Sharkawy I., YALÇIN MENDİ N. Y.

INternational Symposium on Biotechnology and Other Omics in Vegetable SCience (ISHS), Antalya, Turkey, 29 April - 02 May 2012, pp.10, (Summary Text)

2012

20. Somatic embryogenesis in Cyclamen

Koçak M., İzgü T., ÇÜRÜK P., Sevindik B., Tütüncü M., Sanal D., et al.

XI International Symposium on Flower Bulbs and Herbaceous Perennials (ISHS), Antalya, Turkey, 28 March - 01 April 2012, pp.11, (Summary Text)

2010

21. Investigation of the Self Incompatibility Mechanism in Clementine (Citrus clementina Hort. ex Tan.) Using cDNA-AFLP

Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., Mendi Y. Y., Yildirim B., YEŞİLOĞLU T., DISTEFANO G., et al.

28th Int Horticultural Congress on Science and Horticulture for People (IHC) / Int Symposium on Genomics and Genetic Transformation of Horticultural Crops, Lisbon, Portugal, 22 - 27 August 2010, vol.929, pp.233-236, (Full Text)

2012

22. Evaluation of genetic relationships on single, triple and double cross melon (Cucumis melo var. cantalupensis) hybrids by SSR markers

Yilmaz N., Kacar Y. A., SARI N., ŞİMŞEK Ö., SOLMAZ İ.

10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.544-550, (Full Text)

2012

23. Genetic transformation in melon

MENDI Y., Izgu T., Kacar Y. A., SOLMAZ İ., ŞİMŞEK Ö., SARI N.

10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.528-534, (Full Text)

2011

24. Hint İnciri (Opuntia ficus indica)’ nin İn vitro Koşullarda Çoğaltımı ve Rejenerasyonu

EMAN Ş. B., BONCUK M., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.

VI. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.608-611, (Full Text)

2011

25. Safran ve Bazı Crocus Türlerinin RAPD Markırları ile Genetik İlişkilerinin Araştırılması

DÖNMEZ D., SEVİNDİK B., İZGÜ T., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.

VI. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 4 - 08 October 2011, (Full Text)

2011

26. Cucurbitaceae Familyasındaki Bazı Çeşitlerde In vitro Tuz Stresinin Çimlenme Üzerine Etkisinin Araştırılması

İzgü T., Döner A., Demirhan Ş., Tulukoğlu S., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

VI. Bahçe Bitkileri Kongresi, Şanlıurfa, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.506-511, (Full Text)

2011

27. Cucurbitaceae familyasındaki bazı çeşitlerde in vitro tuz stresinin çimlenme üzerine etkisinin araştırılması

İzgü t., Döner A., Demirhan Ş., Tulukoğlu S., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

VI Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Şanlıurfa, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.12-14, (Full Text)

2009

28. In Vitro Plant Regeneration of 'Carrizo' Citrange and 'Cleopatra' Mandarin by Organogenesis

Kacar Y. A., Mendi Y. Y., ŞİMŞEK Ö., YEŞİLOĞLU T., BONCUK M.

2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.305-310, (Full Text)

2009

29. Determination by SSCP Markers of the Allelic Diversity of Candidate Genes for Tolerance to Iron Chlorosis in Citrus Germplasm

ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A., YEŞİLOĞLU T., OLLITRAULT P.

2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.85-91, (Full Text)

2010

30. Keçiboynuzu (Ceratonia silica) genotiplerinin RAPD ve SRAP teknikleriyle Moleküler Kakterizasyonu

KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., BONCUK M., ASLAN F., YILMAZ N., YALÇIN MENDİ N. Y.

IV. Süs Bitkileri Kongresi, Turkey, 20 - 22 October 2010, (Full Text)

2010

31. Cyclamen (Cyclamen sp.)’de in vitro rejenerasyon

YALÇIN MENDİ N. Y., İZGÜ T., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., KOÇAK M., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., et al.

IV. Süs Bitkileri Kongresi, Turkey, 20 - 22 October 2010, (Full Text)

2008

32. Efficiency of different culture mediums and explant types of some Citrus rootstocks on somatic embryogenesis

KAÇAR Y., BİÇEN B., VAROL İ., YEŞİLOĞLU T., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., et al.

XIth International Congress Citrus, China, 26 - 30 October 2008, (Summary Text)

2007

33. Turunçgil Genetik Kaynaklarının RAPD Markırları ile Moleküler Karakterizasyonu

KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YILMAZ B., YEŞİLOĞLU T., TUZCU Ö.

15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Turkey, 28 - 31 October 2007, (Summary Text)

Books

2018

1. AGROBACTERIUM RHIZOGENES VE ROL GENLERİNİN MEYVE TÜRLERİNDE KULLANIMIYazarlarDicle Dönmez, Özhan Şimşek, Yıldız Aka Kaçar

DÖNMEZ D., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.

in: ZIRAAT, ORMAN VE SU ÜRÜNLERI ALANINDA YENILIKÇI YAKLAŞIMLAR, Prof. Dr. Nigar YARPUZ-BOZDOĞAN, Doç. Dr. Emrah DÖNMEZ, Doç. Dr. Ufuk ÇOŞKUN, Editor, Gece Akademi, Ankara, pp.90-106, 2018

2014

2. Genler ve Genomlar

AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

in: Moleküler Biyoloji, Karataş M., Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, Ankara, pp.159-172, 2014

2014

3. Genler ve Genomlar

KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

in: Moleküler Biyoloji, Mehmet KARATAŞ, Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, pp.159-172, 2014

2012

4. Transgenik Bitkilerin Tarla Denemeleri

YALÇIN MENDİ N. Y., İzgü T., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P.

in: Bitki Biyoteknolojisi ve Genetik, Öktem, H. A., Yücel, M., Editor, Nobel Yayıncılık, Ankara, pp.311-323, 2012

Funded Projects

2019 - 2021

Alıç Bitkisinin Plantform Biyoreaktör Sistemi ile Mikroçoğaltımı

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project

DÖNMEZ D. (Executive), ŞİMŞEK Ö., YANAR M., AKA KAÇAR Y.

2018 - 2019

Sphathiphyllumun Klasik ve Yeni Nesil Doku Kültürü Teknikleri Kullanılarak Mikroçoğaltımı

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project

AKA KAÇAR Y. (Executive), YALÇIN MENDİ N. Y., ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., BİÇEN B.

2017 - 2019

Preservation and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

ÇÜRÜK P. (Executive), ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., YALÇIN MENDİ N. Y.

2017 - 2018

6. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö., KORKMAZ GÜVENMEZ H.

2017 - 2018

De novo Assembly and Characterization of the Transcriptome during Seed Development and Generation of Genic-SSR Markers in Pomegranate (Punica granatum L.)

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

ŞİMŞEK Ö. (Executive), AKA KAÇAR Y., İMRAK B.

2017 - 2018

Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In Vitro Conditions

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö.

2017 - 2017

RNASeq Analysis to Detect Genes Involved in Nucellar Embryony Mechanism in Citrus

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

ŞİMŞEK Ö. (Executive), AKA KAÇAR Y.

2017 - 2017

Determination of Genes Involved in Lignification of Pomegranate Seeds by Transcriptome Sequencing

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö.

2016 - 2017

Evaluation and Comparison of A New Type of Temporary Immersion System TIS Bioreactors for Myrtle (Myrtus communis L.)

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

ŞİMŞEK Ö. (Executive), DÖNMEZ D., BİÇEN B., AKA KAÇAR Y.

2014 - 2016

Farklı Acur Genotiplerinin SSR Markırları ile Genetik Karakterizasyonu

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project

SOLMAZ İ. (Executive), AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.

2015 - 2015

Evaluation of genetic relationships among Hungarian and Turkish melon Cucumis melo accessions by SSR markers

Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other

SOLMAZ İ. (Executive), SARI N., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.

2009 - 2011

Turunçgillerde Eşeysel Uyuşmazlık Mekanizmasının Moleküler ve Histolojik Yöntemlerle Araştırılması

TUBITAK Project

2008 - 2010

Kavun (Cucumis melo L.) Islahında Yeni Yaklaşımlar ve Genetik Çeşitlilik Üzerinde Araştırmalar

TUBITAK Project

Memberships and Roles in Scientific Organizations

2016 - Continues

EUCARPIA (European Association for Research on Plant Breeding)

Member

2016 - Continues

International Society of Citriculture

Member

2011 - Continues

International Society for Horticultural Science (ISHS)

Member

2011 - Continues

Bahçe Bitkileri Derneği

Member

2007 - Continues

Biyoteknoloji Derneği

Member

Peer Reviews in Scientific Publications

October 2016

TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY

SCI Journal

May 2016

African Journal of Agricultural Research

SCI Journal

April 2016

African Journal of Microbiology Research

SCI Journal

March 2016

Biochemical Genetics

SCI Journal

Congress and Symposium Activities

01 May 2016 - 01 May 2016

Second Symposium on EuroAsian Biodiversity

Attendee

Antalya-Turkey

01 April 2016 - 01 April 2016

Bitkilerde Uygulamalı Moleküler Markır, Gen Ekspresyonu ve Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri Eğitimi

Invited Speaker

Adana-Turkey

01 March 2016 - 01 March 2016

IV. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 January 2016 - 01 January 2016

XXIV. Plant and Animal Genome Conference

Attendee

California-United States Of America

01 December 2015 - 01 December 2015

18. Biyoteknoloji Kongresi

Attendee

Konya-Turkey

01 August 2015 - 01 August 2015

Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi

Attendee

Çanakkale-Turkey

01 June 2015 - 01 June 2015

XIV International Eucarpia Symposium on Fruit Breeding and Genetics

Attendee

Bologna-Italy

01 March 2015 - 01 March 2015

III. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Invited Speaker

Adana-Turkey

01 November 2014 - 01 November 2014

Küresel İklim Değişikliği ve Tarıma Etkileri

Attendee

Aydın-Turkey

01 September 2014 - 01 September 2014

Balkan Agriculture Congress

Attendee

Edirne-Turkey

01 March 2014 - 01 March 2014

II. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 November 2013 - 01 November 2013

International Plant Breeding Congress

Attendee

Antalya-Turkey

01 April 2013 - 01 April 2013

I. Mediterranean Symp. on Medicinal and Aromatic Plants

Attendee

Gazimagusa-Cyprus (Kktc)

01 March 2013 - 01 March 2013

I. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 November 2012 - 01 November 2012

12th International Citrus Congress

Attendee

Valencia-Spain

01 October 2011 - 01 October 2011

Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi

Attendee

Ş.Urfa-Turkey

01 October 2010 - 01 October 2010

1. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi

Attendee

Antalya-Turkey

01 November 2009 - 01 November 2009

2nd International Citrus Biotechnology Symposium

Attendee

Catania-Italy

01 March 2008 - 01 March 2008

Panel: Neden Biyoteknoloji?

Panelists

Adana-Turkey

01 October 2007 - 01 October 2007

XV. Biyoteknoloji Kongresi, Antalya

Attendee

Antalya-Turkey

Scholarships

2012 - Continues

Erasmus Öğrenci Değişim Bursu (Staj Hareketliliği)

European Commission

2009 - Continues

Erasmus Öğrenci Değişim Bursu

European Commission

2002 - Continues