MD ÖZHAN ŞİMŞEK


Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri

Bahçe Bitkileri


Research Areas: Agricultural Sciences, Agriculture, Garden Plants, Fruit Breeding and Breeding, Biotechnology and Genetics

Email: osimsek@cu.edu.tr
Office Phone: +90 322 338 6388 Extension: 2158
Fax Phone: +90 322 338 6388
Address: Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü, Sarıçam, Adana, 01330

Metrics

Publication

81

Citation (WoS)

196

H-Index (WoS)

8

Citation (Scopus)

225

H-Index (Scopus)

8

Project

19

Open Access

2
UN Sustainable Development Goals

Education Information

2009 - 2016

2009 - 2016

Doctorate

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Turkey

2007 - 2009

2007 - 2009

Postgraduate

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Turkey

2002 - 2006

2002 - 2006

Undergraduate

Cukurova University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Turkey

Dissertations

2016

2016

Doctorate

TURUNÇGİLLERDE NÜSELLER EMBRİYONİ MEKANİZMASINDA ETKİN OLAN GENLERİN MOLEKÜLER YÖNTEMLER İLE ARAŞTIRILMASI

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı

2009

2009

Postgraduate

BAZI TURUNÇGİL ANAÇLARINDA DEMİR (Fe) KLOROZUNA DAYANIKLILIKTAN SORUMLU GENLERİN SSCP MARKIRLARIYLA ALLELİK ÇEŞİTLİLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı

Foreign Languages

B2 Upper Intermediate

B2 Upper Intermediate

English

Certificates, Courses and Trainings

2015

2015

Bitki Islahında Mutasyon ve İlgili Biyoteknolojik Teknikler Eğitimi

Education Management and Planning

Türkiye Atom Enerjisi Kurumu, Sarayköy Nükleer Araştırma ve Eğitim Merkezi

2015

2015

Bitki Islahında DNA Markırları, Gen Ekspresyonu ve Mikro RNA Teknolojisi Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2014

2014

Süs Bitkileri Islahı Kursu (Klasik ve Biyoteknolojik Yöntemler)

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2014

2014

Uygulamalı Haploid Bitki Üretimi ve Kromozom Katlaması Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2013

2013

Uygulamalı DNA Markırları ve Bitki Islahında Kullanımı Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2013

2013

Uygulamalı Bitki Doku Kültürleri ve Genetik Mühendisliği Kursu

Education Management and Planning

Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

2012

2012

Nano Teknoloji Temelli Real-Tıme PCR Teknikleri Uygulamalı Kursu

Education Management and Planning

Mersin Üniversitesi, İleri Teknoloji Eğitim, Araş. ve Uyg. Merkezi

2010

2010

Genetik Çalışmalarda Biyoinformatik Uygulamalar

Education Management and Planning

TÜBİTAK MAM

2010

2010

Genetik Kış Okulu

Education Management and Planning

İstanbul Üniversitesi

2008

2008

Uygulamalı RNA Interferance Kursu

Education Management and Planning

Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü

Research Areas

Agricultural Sciences

Agriculture

Garden Plants

Fruit Breeding and Breeding

Biotechnology and Genetics

Academic Titles / Tasks

2016 - Continues

2016 - Continues

Medical Doctor

Cukurova University, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü

2011 - 2016

2011 - 2016

Research Assistant

Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Bölümü

Managerial Experience

Non Academic Experience

2012 - Continues

2012 - Continues

Biyolog

Çukurova Üniversitesi/Ziraat Fakültesi

2008 - 2008

2008 - 2008

State Agency, Ivıa (Valencia Tarımsal Araştırma Enstitüsü), Valencia, İspanya

Courses

Associate Degree

Associate Degree

Botanik

Associate Degree

Associate Degree

Botanik

Published journal articles indexed by SCI, SSCI, and AHCI

Articles Published in Other Journals

Refereed Congress / Symposium Publications in Proceedings

2019

2019

Plant Genome Sequences: Past, Present and Future

ŞİMŞEK Ö.

Plant Science and Technology Congress, 18 - 20 December 2019

2016

2016

Bazı Zeytin Çeşitlerinin Çeliklerinin Köklenme Olanaklarının Araştırılması

Tütüncü M., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., ŞİMŞEK Ö., İzgü T., KÜDEN A.

VII. Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Turkey, 25 - 29 August 2016, vol.1, no.3, pp.379-383

2015

2015

Orta-Geç Yeni Mandarin Çeşitlerinin Melezleme Islahı Yoluyla Geliştirilmesi

YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., ÇİMEN B., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., YILMAZ B., et al.

Ulusal Tarım Kongresi 2015, Afyon, Turkey, 29 - 31 October 2015, vol.1, no.1, pp.37

2012

2012

Determination of Self-Incompatibility Status of Some Clementine (Citrus clementina) Genotypes by Histological Analysis

Kacar Y., ASLAN F., ETİ S., Boncuk M., ŞİMŞEK Ö., YILDIRIM B., et al.

12th International Citrus Congress - International-Society-of-Citriculture, Valencia, Spain, 18 - 23 November 2012, vol.1065, pp.523-528 Sustainable Development identifier

2012

2012

Research on Transformation Efficiency of Cm-AAT Genes (1,3 and 4) Respons,ible for Aroma Synthesis in Melon (Cucumis melo L., var cantalupensis Naud)

izgü T., Kocaman E., Şimşek Ö., El-Sharkawy I., YALÇIN MENDİ N. Y.

INternational Symposium on Biotechnology and Other Omics in Vegetable SCience (ISHS), Antalya, Turkey, 29 April - 02 May 2012, pp.10

2012

2012

Somatic embryogenesis in Cyclamen

Koçak M., İzgü T., ÇÜRÜK P., Sevindik B., Tütüncü M., Sanal D., et al.

XI International Symposium on Flower Bulbs and Herbaceous Perennials (ISHS), Antalya, Turkey, 28 March - 01 April 2012, pp.11

2010

2010

Investigation of the Self Incompatibility Mechanism in Clementine (Citrus clementina Hort. ex Tan.) Using cDNA-AFLP

Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., Mendi Y. Y., Yildirim B., YEŞİLOĞLU T., DISTEFANO G., et al.

28th Int Horticultural Congress on Science and Horticulture for People (IHC) / Int Symposium on Genomics and Genetic Transformation of Horticultural Crops, Lisbon, Portugal, 22 - 27 August 2010, vol.929, pp.233-236 identifier identifier

2012

2012

Evaluation of genetic relationships on single, triple and double cross melon (Cucumis melo var. cantalupensis) hybrids by SSR markers

Yilmaz N., Kacar Y. A., SARI N., ŞİMŞEK Ö., SOLMAZ İ.

10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.544-550 identifier

2012

2012

Genetic transformation in melon

MENDI Y., Izgu T., Kacar Y. A., SOLMAZ İ., ŞİMŞEK Ö., SARI N.

10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.528-534 identifier

2009

2009

In Vitro Plant Regeneration of 'Carrizo' Citrange and 'Cleopatra' Mandarin by Organogenesis

Kacar Y. A., Mendi Y. Y., ŞİMŞEK Ö., YEŞİLOĞLU T., BONCUK M.

2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.305-310 identifier identifier

2009

2009

Determination by SSCP Markers of the Allelic Diversity of Candidate Genes for Tolerance to Iron Chlorosis in Citrus Germplasm

ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A., YEŞİLOĞLU T., OLLITRAULT P.

2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.85-91 identifier identifier

Books & Book Chapters

2018

2018

AGROBACTERIUM RHIZOGENES VE ROL GENLERİNİN MEYVE TÜRLERİNDE KULLANIMIYazarlarDicle Dönmez, Özhan Şimşek, Yıldız Aka Kaçar

DÖNMEZ D., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.

in: ZIRAAT, ORMAN VE SU ÜRÜNLERI ALANINDA YENILIKÇI YAKLAŞIMLAR, Prof. Dr. Nigar YARPUZ-BOZDOĞAN, Doç. Dr. Emrah DÖNMEZ, Doç. Dr. Ufuk ÇOŞKUN, Editor, Gece Akademi, Ankara, pp.90-106, 2018 Sustainable Development

2014

2014

Genler ve Genomlar

AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

in: Moleküler Biyoloji, Karataş M., Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, Ankara, pp.159-172, 2014

2014

2014

Genler ve Genomlar

KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.

in: Moleküler Biyoloji, Mehmet KARATAŞ, Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, pp.159-172, 2014

2012

2012

Transgenik Bitkilerin Tarla Denemeleri

YALÇIN MENDİ N. Y., İzgü T., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P.

in: Bitki Biyoteknolojisi ve Genetik, Öktem, H. A., Yücel, M., Editor, Nobel Yayıncılık, Ankara, pp.311-323, 2012

Supported Projects

2017 - 2018

2017 - 2018

6. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi

Project Supported by Higher Education Institutions

AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö., KORKMAZ GÜVENMEZ H.

2017 - 2017

2017 - 2017

RNASeq Analysis to Detect Genes Involved in Nucellar Embryony Mechanism in Citrus

Project Supported by Higher Education Institutions

ŞİMŞEK Ö. (Executive), AKA KAÇAR Y.

2017 - 2017

2017 - 2017

Determination of Genes Involved in Lignification of Pomegranate Seeds by Transcriptome SequencingSustainable Development

Project Supported by Higher Education Institutions

AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö.

2014 - 2016

2014 - 2016

Farklı Acur Genotiplerinin SSR Markırları ile Genetik Karakterizasyonu

Project Supported by Higher Education Institutions

SOLMAZ İ. (Executive), AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.

Memberships / Tasks in Scientific Organizations

2016 - Continues

2016 - Continues

EUCARPIA (European Association for Research on Plant Breeding)

Member

2016 - Continues

2016 - Continues

International Society of Citriculture

Member

2011 - Continues

2011 - Continues

International Society for Horticultural Science (ISHS)

Member

2011 - Continues

2011 - Continues

Bahçe Bitkileri Derneği

Member

2007 - Continues

2007 - Continues

Biyoteknoloji Derneği

Member

Scientific Refereeing

October 2016

October 2016

TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY

SCI Journal

May 2016

May 2016

African Journal of Agricultural Research

SCI Journal

April 2016

April 2016

African Journal of Microbiology Research

SCI Journal

March 2016

March 2016

Biochemical Genetics

SCI Journal



Congress and Symposium Activities

01 May 2016 - 01 May 2016

01 May 2016 - 01 May 2016

Second Symposium on EuroAsian Biodiversity

Attendee

Antalya-Turkey

01 April 2016 - 01 April 2016

01 April 2016 - 01 April 2016

Bitkilerde Uygulamalı Moleküler Markır, Gen Ekspresyonu ve Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri Eğitimi

Invited Speaker

Adana-Turkey

01 March 2016 - 01 March 2016

01 March 2016 - 01 March 2016

IV. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 January 2016 - 01 January 2016

01 January 2016 - 01 January 2016

XXIV. Plant and Animal Genome Conference

Attendee

California-United States Of America

01 December 2015 - 01 December 2015

01 December 2015 - 01 December 2015

18. Biyoteknoloji Kongresi

Attendee

Konya-Turkey

01 August 2015 - 01 August 2015

01 August 2015 - 01 August 2015

Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi

Attendee

Çanakkale-Turkey

01 June 2015 - 01 June 2015

01 June 2015 - 01 June 2015

XIV International Eucarpia Symposium on Fruit Breeding and Genetics

Attendee

Bologna-Italy

01 March 2015 - 01 March 2015

01 March 2015 - 01 March 2015

III. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Invited Speaker

Adana-Turkey

01 November 2014 - 01 November 2014

01 November 2014 - 01 November 2014

Küresel İklim Değişikliği ve Tarıma EtkileriSustainable Development

Attendee

Aydın-Turkey

01 September 2014 - 01 September 2014

01 September 2014 - 01 September 2014

Balkan Agriculture CongressSustainable Development

Attendee

Edirne-Turkey

01 March 2014 - 01 March 2014

01 March 2014 - 01 March 2014

II. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 November 2013 - 01 November 2013

01 November 2013 - 01 November 2013

International Plant Breeding Congress

Attendee

Antalya-Turkey

01 April 2013 - 01 April 2013

01 April 2013 - 01 April 2013

I. Mediterranean Symp. on Medicinal and Aromatic Plants

Attendee

Gazimagusa-Cyprus (Kktc)

01 March 2013 - 01 March 2013

01 March 2013 - 01 March 2013

I. Çukurova Biyoteknoloji Günleri

Attendee

Adana-Turkey

01 November 2012 - 01 November 2012

01 November 2012 - 01 November 2012

12th International Citrus Congress

Attendee

Valencia-Spain

01 October 2011 - 01 October 2011

01 October 2011 - 01 October 2011

Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi

Attendee

Ş.Urfa-Turkey

01 October 2010 - 01 October 2010

01 October 2010 - 01 October 2010

1. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi

Attendee

Antalya-Turkey

01 November 2009 - 01 November 2009

01 November 2009 - 01 November 2009

2nd International Citrus Biotechnology Symposium

Attendee

Catania-Italy

01 March 2008 - 01 March 2008

01 March 2008 - 01 March 2008

Panel: Neden Biyoteknoloji?

Panelists

Adana-Turkey

01 October 2007 - 01 October 2007

01 October 2007 - 01 October 2007

XV. Biyoteknoloji Kongresi, Antalya

Attendee

Antalya-Turkey

Scholarships

2012 - Continues

2012 - Continues

Erasmus Öğrenci Değişim Bursu (Staj Hareketliliği)

European Commission

2009 - Continues

2009 - Continues

Erasmus Öğrenci Değişim Bursu

European Commission

2002 - Continues

2002 - Continues

Adana Ticaret Odası Başarılı Öğrenci Bursu

Special Institutions and Organizations

Citations

Total Citations (WOS): 197

h-index (WOS): 8