Education Information
2009 - 2016
2009 - 2016Doctorate
Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, Turkey
2007 - 2009
2007 - 2009Postgraduate
Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Turkey
2002 - 2006
2002 - 2006Undergraduate
Cukurova University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Turkey
Dissertations
2016
2016Doctorate
TURUNÇGİLLERDE NÜSELLER EMBRİYONİ MEKANİZMASINDA ETKİN OLAN GENLERİN MOLEKÜLER YÖNTEMLER İLE ARAŞTIRILMASI
Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı
2009
2009Postgraduate
BAZI TURUNÇGİL ANAÇLARINDA DEMİR (Fe) KLOROZUNA DAYANIKLILIKTAN SORUMLU GENLERİN SSCP MARKIRLARIYLA ALLELİK ÇEŞİTLİLİĞİNİN ARAŞTIRILMASI
Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı
Foreign Languages
B2 Upper Intermediate
B2 Upper IntermediateEnglish
Certificates, Courses and Trainings
2015
2015Bitki Islahında Mutasyon ve İlgili Biyoteknolojik Teknikler Eğitimi
Education Management and Planning
Türkiye Atom Enerjisi Kurumu, Sarayköy Nükleer Araştırma ve Eğitim Merkezi
2015
2015Bitki Islahında DNA Markırları, Gen Ekspresyonu ve Mikro RNA Teknolojisi Kursu
Education Management and Planning
Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi
2014
2014Süs Bitkileri Islahı Kursu (Klasik ve Biyoteknolojik Yöntemler)
Education Management and Planning
Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi
2014
2014Uygulamalı Haploid Bitki Üretimi ve Kromozom Katlaması Kursu
Education Management and Planning
Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi
2013
2013Uygulamalı DNA Markırları ve Bitki Islahında Kullanımı Kursu
Education Management and Planning
Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi
2013
2013Uygulamalı Bitki Doku Kültürleri ve Genetik Mühendisliği Kursu
Education Management and Planning
Çukurova Üniversitesi Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi
2012
2012Nano Teknoloji Temelli Real-Tıme PCR Teknikleri Uygulamalı Kursu
Education Management and Planning
Mersin Üniversitesi, İleri Teknoloji Eğitim, Araş. ve Uyg. Merkezi
2010
2010Genetik Çalışmalarda Biyoinformatik Uygulamalar
Education Management and Planning
TÜBİTAK MAM
2010
2010Genetik Kış Okulu
Education Management and Planning
İstanbul Üniversitesi
2008
2008Uygulamalı RNA Interferance Kursu
Education Management and Planning
Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü
Research Areas
Agricultural Sciences
Agriculture
Garden Plants
Fruit Breeding and Breeding
Biotechnology and Genetics
Academic Titles / Tasks
2016 - Continues
2016 - ContinuesMedical Doctor
Cukurova University, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü
2011 - 2016
2011 - 2016Research Assistant
Cukurova University, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Bölümü
Managerial Experience
Non Academic Experience
2008 - 2008
2008 - 2008State Agency, Ivıa (Valencia Tarımsal Araştırma Enstitüsü), Valencia, İspanya
Published journal articles indexed by SCI, SSCI, and AHCI
2019
2019Comparative transcriptome sequencing to determine genes related to the nucellar embryony mechanism in citrus
ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., ETİ S., YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y.
TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY
, vol.43, no.1, pp.58-68, 2019 (SCI-Expanded)
2018
2018EFFECT OF DROUGHT STRESS IN IN VITRO AND DROUGHT RELATED GENE EXPRESSION IN CARRIZO CITRANGE
ŞİMŞEK Ö.
FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN
, vol.27, pp.9167-9171, 2018 (SCI-Expanded)
2017
2017Molecular Characterization of Cyclamen Species Collected from Different Parts of Turkey by RAPD and SRAP Markers
ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P., ASLAN F., BAYRAMOGLU M., Izgu T., da Silva J. A. T., et al.
BIOCHEMICAL GENETICS
, vol.55, no.1, pp.87-102, 2017 (SCI-Expanded)
2016
2016Molecular Characterization of Turkish Cactus Pear (Opuntia spp.) by RAPD Markers
Tütüncü M., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., KÜDEN A.
JOURNAL OF THE PROFESSIONAL ASSOCIATION FOR CACTUS DEVELOPMENT , vol.18, pp.65-77, 2016 (SCI-Expanded)
2016
2016Development of an efficient regeneration protocol for four Cyclamen species endemic to Turkey
Izgu T., Sevindik B., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A., da Silva J. A. T., et al.
PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE
, vol.127, no.1, pp.95-113, 2016 (SCI-Expanded)
2016
2016Genetic Characterization of Turkish Snake Melon (Cucumis melo L. subsp melo flexuosus Group) Accessions Revealed by SSR Markers
SOLMAZ İ., Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., SARI N.
BIOCHEMICAL GENETICS
, vol.54, no.4, pp.534-543, 2016 (SCI-Expanded)
2016
2016Molecular Characterization of Turkish Cactus Pear (& IT;Opuntia & IT;spp.) by RAPD Markers
TÜTÜNCÜ M., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., Kuden A. B.
JOURNAL OF THE PROFESSIONAL ASSOCIATION FOR CACTUS DEVELOPMENT
, vol.18, pp.65-77, 2016 (SCI-Expanded)
2016
2016Genetic diversity within Turkish watermelon [Citrullus lanatus (Thunb.) Matsumura & Nakai] accessions revealed by SSR and SRAP markers
SOLMAZ İ., AKA KAÇAR Y., SARI N., ŞİMŞEK Ö.
TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY
, vol.40, no.3, pp.407-419, 2016 (SCI-Expanded)
2014
2014Somatic embryogenesis of Turkish Cyclamen persicum Mill
Kocak M., Izgu T., Sevindik B., Tutuncu M., Curuk P., ŞİMŞEK Ö., et al.
SCIENTIA HORTICULTURAE
, vol.172, pp.26-33, 2014 (SCI-Expanded)
2014
2014W. Murcott mandarin çeşidinde anter kültürü çalışmaları
AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., YEŞİLOĞLU T., Akgöl M.
DERİM , no.31, pp.37-50, 2014 (SCI-Expanded)
2014
2014W.Murcott Mandarin Çeşidinde Anter Kültürü Çalışmaları
YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., Akgül M.
DERİM , vol.31, no.2, pp.37-50, 2014 (SCI-Expanded)
2014
2014Genetic relationships of some Citrus genotypes based on the candidate iron chlorosis genes
Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., Boncuk M., YEŞİLOĞLU T., OLLITRAULT P.
TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY
, vol.38, no.3, pp.340-347, 2014 (SCI-Expanded)
2013
2013Genetic Transformation in Citrus
Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., Izgu T., Kacar Y. A., Mendi Y. Y.
SCIENTIFIC WORLD JOURNAL
, 2013 (SCI-Expanded)
2012
2012Genetic diversity among melon accessions (Cucumis melo) from Turkey based on SSR markers
Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., SOLMAZ İ., SARI N., Mendi Y. Y.
GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
, vol.11, no.4, pp.4622-4631, 2012 (SCI-Expanded)
2011
2011Relationships among Crataegus accessions sampled from Hatay, Turkey, as assessed by fruit characteristics and RAPD
Serce S., ŞİMŞEK Ö., Toplu C., Kamiloglu O., Caliskan O., Gunduz K., et al.
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION
, vol.58, no.6, pp.933-942, 2011 (SCI-Expanded)
2011
2011Bitkilerde Mutasyonların Tespiti İçin Kullanılan Moleküler Yöntemler
ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.
Alatarım , vol.10, no.1, pp.50-56, 2011 (SCI-Expanded)
2010
2010Discovery of mutations with TILLING and ECOTILLING in plant genomes
ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A.
SCIENTIFIC RESEARCH AND ESSAYS
, vol.5, no.24, pp.3799-3802, 2010 (SCI-Expanded)
2010
2010Genetic characterization of heat tolerant tomato (Solanum lycopersicon) genotypes by SRAP and RAPD markers
Comlekcioglu N., Şimşek Ö., Boncuk M., Aka-Kacar Y.
GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
, vol.9, no.4, pp.2263-2274, 2010 (SCI-Expanded)
2009
2009Bazı Turunçgil Anaçlarının SSR Markırları ile Moleküler Tanımlanması
YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., Kamiloğlu M., İncesu M.
Alatarım , vol.8, no.2, pp.8-16, 2009 (SCI-Expanded)
2009
2009In vitro Doku Kültürü ve Su Kültürü Koşullarında Maxma 14 Kiraz Anacına Artan Dozlarda Uygulanan Kadmiyum?un Bitki Büyümesi ve Kadmiyum Alımına Etkisi
ALKAN TORUN A., AKA KAÇAR Y., Çakmak O., ŞİMŞEK Ö., Erdem H., Yardım P., et al.
Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.13, no.4, pp.1-11, 2009 (SCI-Expanded)
2008
2008Relationships among myrtle accessions from Turkey as revealed by fruit characteristics and RAPD
Serce S., ŞİMŞEK Ö., Gunduz K., Aka-Kacar Y., ERCİŞLİ S.
ROMANIAN BIOTECHNOLOGICAL LETTERS
, vol.13, no.6, pp.4054-4065, 2008 (SCI-Expanded)
2008
2008Molecular and pomological diversity among pomegranate (Punica granatum L.) cultivars in Eastern Mediterranean region of Turkey
Durgac C., Ozgen M., Simsek O., Kacar Y. A., Kiyga Y., Celebi S., et al.
AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
, vol.7, no.9, pp.1294-1301, 2008 (SCI-Expanded)
Articles Published in Other Journals
2018
2018Narda (Punica granatum L.) Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi Kullanılarak SSRMarkırlarının Geliştirilmesi
Şimşek Ö., Dönmez D., İMRAK B., ÖZGÜVEN A. I., KAÇAR Y.
International Journal of Agriculture and Wildlife Science (IJAWS) , 2018 (Peer-Reviewed Journal)
2017
2017The effects of different explants, basal media and growth regulators on regeneration of carob (Ceratonia siliqua L.)
Curuk P., İzgü T., Şimşek Ö., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., YALÇIN MENDİ N. Y.
JOURNAL OF APPLIED BIOLOGICAL SCIENCES , vol.11, no.3, pp.10-19, 2017 (Peer-Reviewed Journal)
2017
2017Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In Vitro Conditions
ŞİMŞEK Ö., BİÇEN B., DÖNMEZ D., AKA KAÇAR Y.
International Journal of Environmental & Agriculture Research (IJOEAR) , vol.10, pp.54-59, 2017 (Peer-Reviewed Journal)
2017
2017In Vitro Culture of Turkish Origanum sipyleum L.
SEVİNDİK B., İzgü T., Şimşek Ö., Tütüncü M., Curuk P., Yılmaz Ö., et al.
American Journal of Plant Biology , vol.2, no.3, pp.32-36, 2017 (Peer-Reviewed Journal)
2017
2017An Overview of In Vitro Haploid Plant Production in Citrus
Akgöl M., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., AKA KAÇAR Y.
American Journal of Plant Biology. Special Issue:Plant Molecular Biology and Biotechnology , vol.2, pp.19-23, 2017 (Peer-Reviewed Journal)
2017
2017RNA-Seq Analysis in Fruit Science: A Review
ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., AKA KAÇAR Y.
American Journal of Plant Biology , vol.2, pp.1-7, 2017 (Peer-Reviewed Journal)
2016
2016Genetic Engineering Techniques in Fruit Science
Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.
International Journal of Environmental & Agriculture Research (IJOEAR) , vol.2, no.12, pp.115-128, 2016 (Peer-Reviewed Journal)
2016
2016Bazı Kavun Çeşitlerine NHX-1 Geninin Transformasyonu
İZGÜ T., SEVİNDİK B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
ÇUKUROVA TARIM VE GIDA BİLİMLERİ DERGİSİ , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)
2016
2016Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties
izgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
Çukurova Tarım Gıda Bil. Der. , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)
2016
2016Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties
izgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
Çukurova Tarım Gıda Bil. Der. , vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)
2016
2016Transformation of NHX-1 Gene into Some Melon Varieties
İZGÜ T., SEVİNDİK B., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
Çukurova Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi
, vol.31, no.2, pp.1-8, 2016 (Peer-Reviewed Journal)
2015
2015Yeni Nesil DNA Dizileme Teknolojileri ve Bitkilerde Kullanımı
Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.
Türk Bilimsel Derlemeler Dergisi , no.8, pp.30-37, 2015 (Peer-Reviewed Journal)
2014
2014Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi
YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.
Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.7, no.1, pp.80-85, 2014 (Scopus)
2014
2014Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi
YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.
Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.7, no.1, pp.80-85, 2014 (Scopus)
2013
2013Turunçgil Sektörünün Gereksinim Duyduğu Yeni Çeşitlerin Geliştirilmesi
YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., Incesu M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., Şimşek Ö.
Tarım Bilimleri Araştırma Dergisi , vol.6, no.2, pp.127-132, 2013 (Scopus)
2013
2013Improving New Varieties For Citrus Sectoral Needs
YEŞİLOĞLU T., ÇİMEN B., İNCESU M., YILMAZ B., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.
Research Journal of Agricultural Sciences , no.2, pp.127-132, 2013 (Peer-Reviewed Journal)
2012
2012Giberellik ASiT(GA3) Uygulamalarının Iris germanica (Süsen)’da Gelişme ve Çiçeklenme Üzerine Etkileri
ÇÜRÜK P., İZGÜ T., KOÇAK M., TÜTÜNCÜ M., TAGİPUR E., ŞİMŞEK Ö., et al.
Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.27, no.1, pp.21-26, 2012 (Peer-Reviewed Journal)
2012
2012Iris germanica (süsen)'da GA3 uygulamalarının gelişme ve çiçeklenme üzerine etkileri
Özgüven A. I., ÇÜRÜK P., izgü t., koçak m., tütüncü m., Tagipur E., et al.
Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi , vol.4, pp.10-13, 2012 (Peer-Reviewed Journal)
2009
2009IN VİTRO DOKU KÜLTÜRÜ VE SU KÜLTÜRÜ KOŞULLARINDA MAXMA 14 KİRAZ ANACINA ARTAN DOZLARDA UYGULANAN KADMİYUM’UN BİTKİ BÜYÜMESİ VE KADMİYUM ALIMINA ETKİSİ
ALKAN TORUN A., KAÇAR Y., ÇAKMAK Ö., ŞİMŞEK Ö., ERDEM H., YARDIM P., et al.
HARRAN ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ DERGİSİ , vol.13, no.4, pp.1-11, 2009 (Peer-Reviewed Journal)
2009
2009Bazı Turunçgil Anaçlarının SSR Markırları ile Moleküler Tanımlanması? Alatarım
AKA KAÇAR Y., YEŞİLOĞLU T., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., İNCESU M., Kamiloğlu M., et al.
Alatarım , no.3, pp.15-22, 2009 (Peer-Reviewed Journal)
2009
2009In Vitro Doku Kültürü Ve Su Kültürü Koşullarında Maxma 14 Kiraz Anacına Artan Dozlarda Uygulanan Kadmiyum?un Bitki Büyümesi Ve Kadmiyum Alımına Etkisi
ALKAN TORUN A., Erdem H., Tolay I., Kacar Y. A., Şimşek Ö., Yardım P.
HARRAN ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ DERGİSİ , vol.13, pp.1-11, 2009 (Peer-Reviewed Journal)
2008
2008Bazı Meyve türlerinde DNA İzolasyon Etkinliğinin Karşılaştırılması
ŞİMŞEK Ö., Karaat F. E., Serçe S., AKA KAÇAR Y.
DERİM , vol.25, no.1, pp.59-69, 2008 (Peer-Reviewed Journal)
Refereed Congress / Symposium Publications in Proceedings
2019
2019Plant Genome Sequences: Past, Present and Future
ŞİMŞEK Ö.
Plant Science and Technology Congress, 18 - 20 December 2019
2018
2018Investigation of Micropropagation Performance of Some Citrus Rootstocks in In Vitro Drought Stress Conditions
ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., AKA KAÇAR Y.
IV. International Agriculture Congress, Nevşehir, Turkey, 5 - 08 July 2018, pp.228
2018
2018Cryopreservation of Some Cyclamen Species embryonic callus by vitrification and genetic stability
İZGÜ T., YALÇIN MENDİ N. Y., SEVİNDİK B., KOÇAK M., TÜTÜNCÜ M., ŞİMŞEK Ö.
The Third International Symposium on Plant Cryopreservation, Bangkok, Thailand, 26 - 28 March 2018
2017
2017Somatic embryogenesis of some colchicum species
YALÇIN MENDİ N. Y., ÖZKAYA A., SARI M., ÖZDEMİR M. Ş., Sevindik B., Şimşek Ö., et al.
MOLBİOTECH, Afyon, Turkey, 22 - 25 December 2017, pp.51
2017
2017Effects of different media on micropropagation and rooting of myrtle (Myrtus communis L.) in in vitro conditions
BICEN B., DÖNMEZ D., ŞİMŞEK Ö., Kacar Y.
European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, vol.256
2017
2017Preservation and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods
Izgu T., Sevindik B., TÜTÜNCÜ M., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., et al.
European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, vol.256
2017
2017De Novo Assembly and Characterization of the Transcriptome during Seed Development, and Generation of Genic-SSR Markers in Pomegranate (Punica granatum L.)
ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., İMRAK B., Işık Özgüven A., AKA KAÇAR Y.
ICBT 2017 : 19th International Conference on Biotechnology, Barcelona, Spain, 27 - 28 July 2017, vol.4, no.7, pp.589
2017
2017Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In vitro Conditions
Biçen B., Dönmez D., ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y.
European Biotechnology Congress, Dubrovnik, Croatia, 25 - 27 May 2017, pp.10
2017
2017Preservatıon and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods
İzgü T., Sevindik B., Tütüncü M., Curuk P., Şimşek Ö., AKA KAÇAR Y., et al.
BEWS, Antalya, Turkey, 3 - 05 April 2017, pp.92
2016
2016Evaluation and Comparasion of A New Type of Temporary Immersion System (TIS) Bioreactors for Myrtle (Myrtus communis L.)
ŞİMŞEK Ö., BİÇEN B., DÖNMEZ D., KAÇAR Y.
III International Symposium on Horticulture in Europe, Greece, 17 - 21 October 2016, pp.91
2016
2016Bazı Zeytin Çeşitlerinin Çeliklerinin Köklenme Olanaklarının Araştırılması
Tütüncü M., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., ŞİMŞEK Ö., İzgü T., KÜDEN A.
VII. Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Turkey, 25 - 29 August 2016, vol.1, no.3, pp.379-383
2015
2015Bazı Zeytin Çeşitlerinin Köklenme Olanaklarının Araştırılması
TÜTÜNCÜ M., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., ŞİMŞEK Ö., İZGÜ T., KÜDEN A.
VII. Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 25 August 2015, vol.45
2015
2015Orta-Geç Yeni Mandarin Çeşitlerinin Melezleme Islahı Yoluyla Geliştirilmesi
YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y., ÇİMEN B., ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., YILMAZ B., et al.
Ulusal Tarım Kongresi 2015, Afyon, Turkey, 29 - 31 October 2015, vol.1, no.1, pp.37
2015
2015Nar’da (Punica granatum L.) Yumuşak Sert Çekirdeklilik Oluşum Mekanizmasının Histolojik Yöntemlerle Araştırılması
AKGÖL M., ŞİMŞEK Ö., KARATAŞ N., ETİ S., ÖZGÜVEN A. I., KAÇAR Y.
VII. ULUSAL BAHÇE BİTKİLERİ KONGRESİ, Turkey, 25 - 29 August 2015
2015
2015Gou Tou Turuncu X Yerli Üç Yapraklı Melezinin In Vitro Koşullarda Köklenme Olanaklarının Araştırılması
ŞİMŞEK Ö., Bayramoğlu M., Cengiz M., ÇİMEN B., YEŞİLOĞLU T., AKA KAÇAR Y.
7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Çanakkale, Turkey, 25 - 29 August 2015, vol.1, no.1, pp.290
2012
2012Determination of Self-Incompatibility Status of Some Clementine (Citrus clementina) Genotypes by Histological Analysis
Kacar Y., ASLAN F., ETİ S., Boncuk M., ŞİMŞEK Ö., YILDIRIM B., et al.
12th International Citrus Congress - International-Society-of-Citriculture, Valencia, Spain, 18 - 23 November 2012, vol.1065, pp.523-528
2014
2014Cryopreservation of some endemic Cyclamen species of Turkey by vitrification of embryogenic callus cultures
İzgü T., Sevindik B., ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P., AKA KAÇAR Y., YALÇIN MENDİ N. Y.
Balkan Agriculture Congress, Edirne, Turkey, 8 - 11 September 2014, pp.705
2014
2014Preliminary Results of Determining Nucellar Embryo Initial Cells by Histological Analysis
ŞİMŞEK Ö., Dönmez D., ETİ S., KARABIYIK Ş., YALÇIN MENDİ N. Y., YEŞİLOĞLU T., et al.
Balkan Agricultural Congress, Tekirdağ, Turkey, 8 - 10 September 2014, pp.1
2012
2012Research on Transformation Efficiency of Cm-AAT Genes (1,3 and 4) Respons,ible for Aroma Synthesis in Melon (Cucumis melo L., var cantalupensis Naud)
izgü T., Kocaman E., Şimşek Ö., El-Sharkawy I., YALÇIN MENDİ N. Y.
INternational Symposium on Biotechnology and Other Omics in Vegetable SCience (ISHS), Antalya, Turkey, 29 April - 02 May 2012, pp.10
2012
2012Somatic embryogenesis in Cyclamen
Koçak M., İzgü T., ÇÜRÜK P., Sevindik B., Tütüncü M., Sanal D., et al.
XI International Symposium on Flower Bulbs and Herbaceous Perennials (ISHS), Antalya, Turkey, 28 March - 01 April 2012, pp.11
2010
2010Investigation of the Self Incompatibility Mechanism in Clementine (Citrus clementina Hort. ex Tan.) Using cDNA-AFLP
Kacar Y. A., ŞİMŞEK Ö., Mendi Y. Y., Yildirim B., YEŞİLOĞLU T., DISTEFANO G., et al.
28th Int Horticultural Congress on Science and Horticulture for People (IHC) / Int Symposium on Genomics and Genetic Transformation of Horticultural Crops, Lisbon, Portugal, 22 - 27 August 2010, vol.929, pp.233-236
2012
2012Evaluation of genetic relationships on single, triple and double cross melon (Cucumis melo var. cantalupensis) hybrids by SSR markers
Yilmaz N., Kacar Y. A., SARI N., ŞİMŞEK Ö., SOLMAZ İ.
10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.544-550
2012
2012Genetic transformation in melon
MENDI Y., Izgu T., Kacar Y. A., SOLMAZ İ., ŞİMŞEK Ö., SARI N.
10th EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, Antalya, Turkey, 15 - 18 October 2012, pp.528-534
2011
2011Hint İnciri (Opuntia ficus indica)’ nin İn vitro Koşullarda Çoğaltımı ve Rejenerasyonu
EMAN Ş. B., BONCUK M., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.
VI. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.608-611
2011
2011Safran ve Bazı Crocus Türlerinin RAPD Markırları ile Genetik İlişkilerinin Araştırılması
DÖNMEZ D., SEVİNDİK B., İZGÜ T., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.
VI. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Turkey, 4 - 08 October 2011
2011
2011Cucurbitaceae Familyasındaki Bazı Çeşitlerde In vitro Tuz Stresinin Çimlenme Üzerine Etkisinin Araştırılması
İzgü T., Döner A., Demirhan Ş., Tulukoğlu S., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
VI. Bahçe Bitkileri Kongresi, Şanlıurfa, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.506-511
2011
2011Cucurbitaceae familyasındaki bazı çeşitlerde in vitro tuz stresinin çimlenme üzerine etkisinin araştırılması
İzgü t., Döner A., Demirhan Ş., Tulukoğlu S., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
VI Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Şanlıurfa, Turkey, 4 - 08 October 2011, pp.12-14
2009
2009In Vitro Plant Regeneration of 'Carrizo' Citrange and 'Cleopatra' Mandarin by Organogenesis
Kacar Y. A., Mendi Y. Y., ŞİMŞEK Ö., YEŞİLOĞLU T., BONCUK M.
2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.305-310
2009
2009Determination by SSCP Markers of the Allelic Diversity of Candidate Genes for Tolerance to Iron Chlorosis in Citrus Germplasm
ŞİMŞEK Ö., Kacar Y. A., YEŞİLOĞLU T., OLLITRAULT P.
2nd International Symposium on Citrus Biotechnology, Catania, Italy, 30 November - 02 December 2009, vol.892, pp.85-91
2010
2010Keçiboynuzu (Ceratonia silica) genotiplerinin RAPD ve SRAP teknikleriyle Moleküler Kakterizasyonu
KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., BONCUK M., ASLAN F., YILMAZ N., YALÇIN MENDİ N. Y.
IV. Süs Bitkileri Kongresi, Turkey, 20 - 22 October 2010
2010
2010Cyclamen (Cyclamen sp.)’de in vitro rejenerasyon
YALÇIN MENDİ N. Y., İZGÜ T., ÇÖMLEKÇİOĞLU S., KOÇAK M., ÇÜRÜK P., ŞİMŞEK Ö., et al.
IV. Süs Bitkileri Kongresi, Turkey, 20 - 22 October 2010
2008
2008Efficiency of different culture mediums and explant types of some Citrus rootstocks on somatic embryogenesis
KAÇAR Y., BİÇEN B., VAROL İ., YEŞİLOĞLU T., YILMAZ B., ŞİMŞEK Ö., et al.
XIth International Congress Citrus, China, 26 - 30 October 2008
2007
2007Turunçgil Genetik Kaynaklarının RAPD Markırları ile Moleküler Karakterizasyonu
KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YILMAZ B., YEŞİLOĞLU T., TUZCU Ö.
15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Turkey, 28 - 31 October 2007
Books & Book Chapters
2018
2018AGROBACTERIUM RHIZOGENES VE ROL GENLERİNİN MEYVE TÜRLERİNDE KULLANIMIYazarlarDicle Dönmez, Özhan Şimşek, Yıldız Aka Kaçar
DÖNMEZ D., ŞİMŞEK Ö., KAÇAR Y.
in: ZIRAAT, ORMAN VE SU ÜRÜNLERI ALANINDA YENILIKÇI YAKLAŞIMLAR, Prof. Dr. Nigar YARPUZ-BOZDOĞAN, Doç. Dr. Emrah DÖNMEZ, Doç. Dr. Ufuk ÇOŞKUN, Editor, Gece Akademi, Ankara, pp.90-106, 2018
2014
2014Genler ve Genomlar
AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
in: Moleküler Biyoloji, Karataş M., Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, Ankara, pp.159-172, 2014
2014
2014Genler ve Genomlar
KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., YALÇIN MENDİ N. Y.
in: Moleküler Biyoloji, Mehmet KARATAŞ, Editor, Nobel Akademik Yayıncılık, pp.159-172, 2014
2012
2012Transgenik Bitkilerin Tarla Denemeleri
YALÇIN MENDİ N. Y., İzgü T., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö., ÇÜRÜK P.
in: Bitki Biyoteknolojisi ve Genetik, Öktem, H. A., Yücel, M., Editor, Nobel Yayıncılık, Ankara, pp.311-323, 2012
Supported Projects
2018 - 2019
2018 - 2019Sphathiphyllumun Klasik ve Yeni Nesil Doku Kültürü Teknikleri Kullanılarak Mikroçoğaltımı
Project Supported by Higher Education Institutions
AKA KAÇAR Y. (Executive), YALÇIN MENDİ N. Y., ŞİMŞEK Ö., DÖNMEZ D., BİÇEN B.
2017 - 2019
2017 - 2019Preservation and micropropagation of cyclamen species using biotechnological methods
Project Supported by Higher Education Institutions
ÇÜRÜK P. (Executive), ŞİMŞEK Ö., AKA KAÇAR Y., YALÇIN MENDİ N. Y.
2017 - 2018
2017 - 20186. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi
Project Supported by Higher Education Institutions
AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö., KORKMAZ GÜVENMEZ H.
2017 - 2018
2017 - 2018
De novo Assembly and Characterization of the Transcriptome during Seed Development and Generation of Genic-SSR Markers in Pomegranate (Punica granatum L.)
Project Supported by Higher Education Institutions
ŞİMŞEK Ö. (Executive), AKA KAÇAR Y., İMRAK B.
2017 - 2018
2017 - 2018Effects of Different Media on Micropropagation and Rooting of Myrtle (Myrtus communis L.) in In Vitro Conditions
Project Supported by Higher Education Institutions
AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö.
2017 - 2017
2017 - 2017RNASeq Analysis to Detect Genes Involved in Nucellar Embryony Mechanism in Citrus
Project Supported by Higher Education Institutions
ŞİMŞEK Ö. (Executive), AKA KAÇAR Y.
2017 - 2017
2017 - 2017
Determination of Genes Involved in Lignification of Pomegranate Seeds by Transcriptome Sequencing
Project Supported by Higher Education Institutions
AKA KAÇAR Y. (Executive), ŞİMŞEK Ö.
2016 - 2017
2016 - 2017Evaluation and Comparison of A New Type of Temporary Immersion System TIS Bioreactors for Myrtle (Myrtus communis L.)
Project Supported by Higher Education Institutions
ŞİMŞEK Ö. (Executive), DÖNMEZ D., BİÇEN B., AKA KAÇAR Y.
2014 - 2016
2014 - 2016Farklı Acur Genotiplerinin SSR Markırları ile Genetik Karakterizasyonu
Project Supported by Higher Education Institutions
SOLMAZ İ. (Executive), AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.
2015 - 2015
2015 - 2015Evaluation of genetic relationships among Hungarian and Turkish melon Cucumis melo accessions by SSR markers
Project Supported by Higher Education Institutions
SOLMAZ İ. (Executive), SARI N., AKA KAÇAR Y., ŞİMŞEK Ö.
2009 - 2011
2009 - 2011Turunçgillerde Eşeysel Uyuşmazlık Mekanizmasının Moleküler ve Histolojik Yöntemlerle Araştırılması
TUBITAK Project
2008 - 2010
2008 - 2010Kavun (Cucumis melo L.) Islahında Yeni Yaklaşımlar ve Genetik Çeşitlilik Üzerinde Araştırmalar
TUBITAK Project
Memberships / Tasks in Scientific Organizations
2016 - Continues
2016 - ContinuesEUCARPIA (European Association for Research on Plant Breeding)
Member
2016 - Continues
2016 - ContinuesInternational Society of Citriculture
Member
2011 - Continues
2011 - ContinuesInternational Society for Horticultural Science (ISHS)
Member
2011 - Continues
2011 - ContinuesBahçe Bitkileri Derneği
Member
2007 - Continues
2007 - ContinuesBiyoteknoloji Derneği
Member
Scientific Refereeing
October 2016
October 2016TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
SCI Journal
May 2016
May 2016African Journal of Agricultural Research
SCI Journal
April 2016
April 2016African Journal of Microbiology Research
SCI Journal
March 2016
March 2016Biochemical Genetics
SCI Journal
Congress and Symposium Activities
01 May 2016 - 01 May 2016
01 May 2016 - 01 May 2016Second Symposium on EuroAsian Biodiversity
Attendee
Antalya-Turkey
01 April 2016 - 01 April 2016
01 April 2016 - 01 April 2016Bitkilerde Uygulamalı Moleküler Markır, Gen Ekspresyonu ve Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri Eğitimi
Invited Speaker
Adana-Turkey
01 March 2016 - 01 March 2016
01 March 2016 - 01 March 2016IV. Çukurova Biyoteknoloji Günleri
Attendee
Adana-Turkey
01 January 2016 - 01 January 2016
01 January 2016 - 01 January 2016XXIV. Plant and Animal Genome Conference
Attendee
California-United States Of America
01 December 2015 - 01 December 2015
01 December 2015 - 01 December 201518. Biyoteknoloji Kongresi
Attendee
Konya-Turkey
01 August 2015 - 01 August 2015
01 August 2015 - 01 August 2015Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi
Attendee
Çanakkale-Turkey
01 June 2015 - 01 June 2015
01 June 2015 - 01 June 2015XIV International Eucarpia Symposium on Fruit Breeding and Genetics
Attendee
Bologna-Italy
01 March 2015 - 01 March 2015
01 March 2015 - 01 March 2015III. Çukurova Biyoteknoloji Günleri
Invited Speaker
Adana-Turkey
01 November 2014 - 01 November 2014
01 November 2014 - 01 November 2014
Küresel İklim Değişikliği ve Tarıma Etkileri
Attendee
Aydın-Turkey
01 September 2014 - 01 September 2014
01 September 2014 - 01 September 2014
Balkan Agriculture Congress
Attendee
Edirne-Turkey
01 March 2014 - 01 March 2014
01 March 2014 - 01 March 2014II. Çukurova Biyoteknoloji Günleri
Attendee
Adana-Turkey
01 November 2013 - 01 November 2013
01 November 2013 - 01 November 2013International Plant Breeding Congress
Attendee
Antalya-Turkey
01 April 2013 - 01 April 2013
01 April 2013 - 01 April 2013I. Mediterranean Symp. on Medicinal and Aromatic Plants
Attendee
Gazimagusa-Cyprus (Kktc)
01 March 2013 - 01 March 2013
01 March 2013 - 01 March 2013I. Çukurova Biyoteknoloji Günleri
Attendee
Adana-Turkey
01 November 2012 - 01 November 2012
01 November 2012 - 01 November 201212th International Citrus Congress
Attendee
Valencia-Spain
01 October 2011 - 01 October 2011
01 October 2011 - 01 October 2011Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi
Attendee
Ş.Urfa-Turkey
01 October 2010 - 01 October 2010
01 October 2010 - 01 October 20101. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi
Attendee
Antalya-Turkey
01 November 2009 - 01 November 2009
01 November 2009 - 01 November 20092nd International Citrus Biotechnology Symposium
Attendee
Catania-Italy
01 March 2008 - 01 March 2008
01 March 2008 - 01 March 2008Panel: Neden Biyoteknoloji?
Panelists
Adana-Turkey
01 October 2007 - 01 October 2007
01 October 2007 - 01 October 2007XV. Biyoteknoloji Kongresi, Antalya
Attendee
Antalya-Turkey
Scholarships
2012 - Continues
2012 - ContinuesErasmus Öğrenci Değişim Bursu (Staj Hareketliliği)
European Commission
2009 - Continues
2009 - ContinuesErasmus Öğrenci Değişim Bursu
European Commission
2002 - Continues
2002 - Continues