KSU TARIM VE DOGA DERGISI-KSU JOURNAL OF AGRICULTURE AND NATURE, vol.25, no.6, pp.1378-1389, 2022 (Peer-Reviewed Journal)
Diaporthe ampelina (=Phomopsis viticola) is one of the most
important pathogens causing both cane/leaf spot and wood canker
diseases in grape growing countries in the world. In this research,
morphological, molecular and pathogenic characterization of 23 D.
ampelina isolates were studied and their sensitivity was tested
against hot-water treatments and some of the fungicides used in
vineyards. Morphologically, the isolates were grouped according to
“W type” and “G type” colony appearance and microscopic features.
In molecular characterization, beta-tubulin, calmodulin and
translation elongation factor (tef1-α) gene regions were amplified
with PCR. The nucleotide sequences were analyzed using NCBIBLAST search and recorded in GenBank, through which species
identity was also confirmed. Mycelial viability was tested against
hot-water treatments (46 – 50°C for 30 and 45 min) in centrifuge
tubes and thermal inactivation point was determined. It was also
tested against some of the fungicides (azoxystrobin, boscalid,
cyprodinil, tebuconazole, azoxystrobin + cyproconazole +
tebuconazole, cyprodinil + fludioxonil, azoxystrobin + tebuconazole
and fludioxonil) in vitro and EC50 values were calculated. The
morphological and molecular study results showed that all the
isolates were D. ampelina and they were pathogenic on wood tissues
of vines. Thermal inactivation of “W type” isolates was ensured at
48°C-30 min hot-water treatments. Although this treatment also
reduced colony growth of “G type” isolates, it did not inhibit it
completely and 48°C-45 min treatment was needed to reach full
eradication. Considering fungicide sensitivity, fludioxonil or
tebuconazole containing fungicides were the most effective in
suppressing the mycelial growth of the fungus. However,
azoxystrobin, boscalid, cyprodinil could not perform a strong
inhibition when compared to fludioxonil and tebuconazole.
Diaporthe ampelina (=Phomopsis viticola) dünyadaki üzüm
yetiştirilen ülkelerde hem sürgün/yaprak lekesi hem de odun
kangrenine neden olan en önemli patojenlerden biridir. Bu
araştırmada, 23 D. ampelina izolatının morfolojik, moleküler ve
patojenik karakterizasyonu çalışılmış ve bunların bağcılıkta
kullanılan bazı fungisitlere ve sıcak su uygulamalarına karşı
duyarlılığı test edilmiştir. Morfolojik olarak izolatlar, “W” tipi ya da
“G” tipi koloni görünümleri ve mikroskobik özelliklerine göre
gruplandırılmıştır. Moleküler karakterizasyonda beta-tubulin,
calmodulin ve translation elongation factor (tef1-α) gen bölgeleri
PCR ile çoğaltılmıştır. Nükleotid dizileri NCBI-BLAST yazılımı
kullanarak analiz edilmiş, gen bankasına kaydedilmiş ve tür tanısı
doğrulanmıştır. Miseliyal canlılık sıcak su uygulamalarına karşı (46–50°C’de 30-45 dk.) santrifüj tüplerinde test edilmiş ve termal
inaktivasyon noktası saptanmıştır. Bu aynı zamanda in vitro’da bazı
fungisitlere karşı (azoxystrobin, boscalid, cyprodinil, tebuconazole,
azoxystrobin + cyproconazole + tebuconazole, cyprodinil +
fludioxonil, azoxystrobin + tebuconazole and fludioxonil) test edilmiş
ve EC50 değerleri hesaplanmıştır. Morfolojik ve moleküler çalışma
sonuçları tüm izolatların D. ampelina olduğunu ve bunların asma
odunsu dokularında patojen olduklarını göstermiştir. “W” tipi
izolatların termal inaktivasyonu 48°C-30 dakikalık sıcak su
uygulamasıyla sağlanmıştır. Bu uygulama “G” tipi izolatların koloni
büyümesini azaltmasına rağmen tamamen inhibe etmemiş, tam
eradikasyona ulaşmak için 48°C-45 dakikalık uygulamaya gerek
duyulmuştur. Fungisit duyarlılığı ele alındığında, fludioxonil ve
tebuconazole içeren fungisitler fungusun miseliyal büyümesini
baskılamada en etkili olmuşlardır. Ancak azoxystrobin, boscalid ve
cyprodinil, fludioxonil ve tebuconazole ile kıyaslandığında güçlü bir
inhibisyon sergileyememiştir.