Adana İli Nektarin Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Bakteriyel Kanser Etmenlerinin İzolasyonu ve Tanımlanması Üzerine Araştırmalar

Karabüyük F., Fidancı Avcı S. B.

8. Uluslararası Katılımlı Bitki Koruma Kongresi, Bolu, Türkiye, 24 - 28 Ağustos 2021, ss.283

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Bolu
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.283
  • Çukurova Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Geniş bir konukçu dizinize sahip olan Pseudomonas syringae pathovarları sert çekirdekli meyve ağacı yetiştiriciliğinin yapıldığı bölgelerde önemli oranda ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bu çalışmada; Adana ili nektarin yetiştiriciliği yapılan alanlarda 2019-2020 yıllarında yapılan sörveylerde bakteriyel kanser hastalığına neden olan P. syringae pathovarlarının neden olduğu tahmin edilen enfekteli bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan enfekteli bitki dokularından yapılan izolasyonların patojenitesi sonucunda, toplam 48 bakteri izolatı elde edilmiştir. Tesadüfen seçilen 20 adet izolat ile sert çekirdekli meyvelerde yaygın olarak hastalığa neden olan Pseudomonas syringae pv. syringae’nin tanısında syrB1-B2 primerler çifti ve Pseudomonas syringae pv. morsprunorum’un tanısında ise CFLF-CFLR primerler çifti kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR; Polymerase Chain Reaction) yapılmıştır. Yapılan elektroforez çalışmaları sonucunda, 11 adet izolatın syrB1-B2 primer çifti ile gerçekleştirilen PCR çalışmaları sonucunda agaroz jel elektroforezinde 752 bp bantlar gözlenmiştir ve bu izolatlar P. syringae pv. syringae olarak tanılanmıştır. PCR metodu ile elde edilen sonuçlar, Matriks ile lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) ile desteklenmiştir. Ayrıca, CFLF-CFLR primer çifti ile gerçekleştirilen çalışmalarda herhangi bir bant gözlenmemiştir. Bu çalışma sonucunda, P. syringae pv. syringae Adana ili nektarin bahçelerinde saptanmış ve moleküler olarak tanılanmıştır.

Anahtar Kelimeler: Nektarin, Pseudomonas syringae pv. syringae, Pseudomonas syringae, MALDI- TOF MS, PCR

-Bu çalışma FBA-2019-12002 numaralı proje ile Çukurova Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından desteklenmiştir. 

Pseudomonas syringae pathovars, which have a wide host range, cause significant economic losses in the regions where stone fruit trees are grown. In this study, infected plant samples which considered to be caused by the casual agent of bacterial cancer of stone fruits was collected during the surveys that carried out in 2019 and 2020 in the nectarine orcards in Adana. As a result of the isolations and pathogenicity test, a total of 48 bacterial isolates were obtained. Polymerase Chain Reaction (PCR) was perform to characterize randomly selected 20 isolates. P. syringae pv. syringae strains were identified using syrB1-B2 primer pairs and also, for Pseudomonas syringae pv. morsprunorum identification, primers responsible for the CFLF-CFLR primer pairs (was used. Following electrophoresis, 11 strains were obtained 752 bp bands on the agarose gel and identified as P. syringae pv. syringae. The results obtained by the PCR method were supported by Matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). And also, no bands were observed with the CFLF-CFLR primer pairs. In the results of study, P. syringae pv. syringae strains were detected and identified with molecular techniques in nectarine orchards in Adana province.

Keywords: Nectarin, Pseudomonas syringae pv. syringae, Pseudomonas syringae, MALDI- TOF MS, PCR


-This study was supported by Çukurova University Scientific Research Projects Coordination Unit with the project number FBA-2019-12002.