Is Stenotrophomonas maltophilia isolated from blood culture “newly emerging pathogen of concern”?


Creative Commons License

Gümüş H. H.

12TH INTERNATIONAL HIPPOCRATES CONGRESS ON MEDICAL AND HEALTH SCIENCES", İstanbul, Turkey, 1 - 02 September 2023, (Summary Text)

  • Publication Type: Conference Paper / Summary Text
  • City: İstanbul
  • Country: Turkey
  • Open Archive Collection: AVESIS Open Access Collection
  • Çukurova University Affiliated: Yes

Abstract

ÖZET

Önceleri sırasıyla Bacterium bookeri, Pseudomonas maltophilia ve Xanthomonas maltophilia olarak isimlendirilen Stenotrophomonas maltophilia, Gammaproteobacteria sınıfına ait, toprak ve su kökenli, fermentatif olmayan bir Gram negatif basildir. Kistik Fibrozis gibi kronik respiratuvar hastalık, malignensi, nötropeni, transplantasyon gibi immun supresyona sebep olan hastalıkların varlığında fırsatçı patojen olarak klinik örneklerden izole edilebilmektedir. Stenotrophomonas maltophilia, Stenotrophomonas cinsinin 17 türü arasında insanı enfekte eden tek türdür. Uzamış hospitalizasyon süresi, mekanik ventilasyon, santral venöz kateter gibi girişimsel medikal cihazların uygulanması ve geniş spektrumlu antibiyotik kullanımı durumunda enfeksiyon oluşturma riski artmaktadır. Stenotrophomonas maltophilia, Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumanii'den sonra en sık görülen üçüncü non-fermentatif Gram negatif basildir. Biyofilm üretme ve intrinsik antimikrobiyal direnç gösterme özellikleri Stenotrophomonas maltophilia enfeksiyonlarının yönetimini güçleştirmektedir. Bu çalışmanın amacı, 1150 yataklı, üçüncü basamak bir hastanenin Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda kan kültürü örneklerinden etken olarak izole edilen Stenotrophomonas maltophilia’nın prevalansını ve Avrupa Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Cemiyeti (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, EUCAST, 2023, v.13.1.) kriterlerine göre antibiyotik duyarlılıklarını retrospektif olarak değerlendirmektir. Bu amaçla, 1 Ocak 2021 ve 30 Haziran 2023 tarihleri arasında Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Balcalı Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda kan kültürlerinden izole edilen 104 Stenotrophomonas maltophilia suşu çalışmaya dahil edildi. Kan kültürlerinden antibiyotik duyarlılık test sonucu aynı olan ve Stenotrophomonas maltophilia’nın izole edildiği aynı setteki bir izolat dahil edildi ve aynı hastanın 14 güne kadar olan mükerrer izolatları ile kontaminasyonlar çalışma dışı tutuldu. Kan kültürleri Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda BACTEC-FX (Becton Dickinson, ABD) otomatize sistemi ile beş gün inkübe edildi. Üreme sinyali veren örneklerden Biyogüvenlik Düzeyi-2 şartlarında Gram boyama ve metilen mavisi ile boyama yapılarak incelendi. Ardından tek koloni ekim yöntemi ile %5 koyun kanlı agar, MacConkey agar ve çikolata agar besiyerlerine pasaj yapılarak 37°C’de 24-48 saat inkübe edildi. Üreyen mikroorganizmaların identifikasyon ve antimikrobiyal duyarlılık testleri konvansiyonel yöntemler ve VITEK 2 Compact ID/AST (bioMeriéux, Marcy-l’Étoile, Fransa) otomatize sistemi ile yapıldı. İlgili dönemde kan kültürlerinin %1.13’ünde Stenotrophomonas maltophilia etken olarak tanımlandı. İzolatların %58.6’sı erkek (n=61) ve kalanı kadın hastalara aitti. Hastaların yaş ortalaması 32.75 ve medyan yaş 52.5 idi. İzolatların %48.1 oranı ile en çok görüldüğü bölüm yoğun bakım ünitesiydi ve bunu sırasıyla onkoloji (%18.3), diğer dahili birimler (hematoloji, enfeksiyon, nefroloji) (%16.3), pediatri (%15.4) ve cerrahi birimler (%1.9) takip etti. Kan kültürü örneklerinin EUCAST (v.13.1.) klinik sınır değerlerine göre Stenotrophomonas maltophilia izolatlarının antimikrobiyal duyarlılığı için araştırılan antibiyotikler trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SXT) ve Türkiye’de henüz bulunmayan cefiderocoldür. Trimethoprim-sulfamethoxazole minimum inhibitör konsatrasyonu >4 mg/L olduğunda dirençli, ≤0.001 mg/L ise duyarlı kabul edilmektedir. Disk difüzyon testinde ise zon çapı <16 mm ise dirençli, ≥50 mm ise yüksek dozda duyarlıdır. Bu klinik sınır değerlere göre, izolatların %99.04’ünün (n=103) TMP-SXT’ye dirençli olduğu tespit edildi. Bir izolat ise yüksek dozda duyarlıydı. Dünyada direnç oranı %29.7 ile %96.3 arasında değişmektedir, ancak son yıllarda direnç oranının arttığı bildirilmektedir. Stenotrophomonas maltophilia kan dolaşımı enfeksiyonlarının yönetimi sınırlı tedavi seçenekleri sebebi ile güçtür. Bu enfeksiyonlarda Amerika Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (Clinical and. Laboratory Standards Institute, CLSI, M100-Ed33:2023) TMP-SXT ve cefiderocol ile beraber ticarcillin-clavulanate, ceftazidime, minocycline, levofloxacin ve chloramphenicol duyarlılık testi yapılmasını da önermektedir. Çalışmamızın sonuçları, hastanemizde kan kültürlerinde Stenotrophomonas maltophilia izolatlarının TMP-SXT’ye direncinin dünya ortalamasının üzerinde, endişe verici düzeyde (%99.04) olduğunu göstermektedir. Risk grubu yoğun bakım ünitesi, onkoloji ve hematoloji bölümlerinde yatan hastalardan oluşmaktaydı.  Yerel ve ulusal düzeylerde etkene spesifik antimikrobiyal direncin eğilimini daha iyi karakterize etmek için lokal verilerin ve çok merkezli sürveyans çalışmalarına ihtiyaç vardır. Türkiye’de uygulanan antibiyotik duyarlılık testi içeriğinin lokal ve ulusal epidemiyolojik veriler ışığında etkene spesifik olarak güncellenmesi gerekmektedir.

Anahtar kelimeler: S. maltophilia, non-fermenter Gram negatif basil, trimethoprim-sulfamethoxazole direnci, surveyans, nosokomiyal enfeksiyon, kan dolaşımı enfeksiyonu.

ABSTRACT

Stenotrophomonas maltophilia, previously named as Bacterium bookeri, Pseudomonas maltophilia and Xanthomonas maltophilia, is a soil and aquatic, non-fermentative Gram negative bacillus belonging to the class Gammaproteobacteria. It can be isolated from clinical samples as an opportunistic pathogen in the presence of chronic respiratory disease such as Cystic Fibrosis, malignancy, neutropenia, and diseases that cause immune suppression such as solid organ transplantation. Stenotrophomonas maltophilia is the only species that infects humans among the 17 species of the genus Stenotrophomonas. The risk of infection increases in the case of prolonged hospitalization duration, mechanical ventilation, application of interventional medical devices such as central venous catheters, and use of broad-spectrum antibiotics. Stenotrophomonas maltophilia is the third most common non-fermentative Gram-negative bacillus after Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumanii. Its biofilm production and intrinsic antimicrobial resistance properties complicate the management of Stenotrophomonas maltophilia infections. The aim of this study was to determine the prevalence of Stenotrophomonas maltophilia, which was isolated as a pathogen from blood cultures in the Microbiology Laboratory of a tertiary hospital with 1.150 beds, and to evaluate antibiotic susceptibilities according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST, 2023, v.13.1.) criteria, retrospectively. For this purpose, 104 Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from blood cultures in Microbiology Laboratory at Çukurova University Medical Faculty Balcalı Hospital between January 1, 2021 and June 30, 2023 were included in the study. The bacteria isolate from the same blood culture set, of which Stenotrophomonas maltophilia was isolated and had the same antibiotic susceptibility test result, was included to the study, and contaminations and duplicate isolates of the same patient up to 14 days were excluded from the study. Blood cultures were incubated for five days with the BACTEC-FX (Becton Dickinson, USA) automated system in the Microbiology Laboratory. Specimens that had a signal of growth were examined by Gram staining and methylene blue staining under Biosafety Level-2 conditions. Then, they were passaged into the 5% sheep blood agar, MacConkey agar and chocolate agar media by single colony planting method, and incubated at 37°C for 24-48 hours. Identification and antimicrobial susceptibility tests of the isolates were performed using conventional methods, and the VITEK 2 Compact ID/AST (bioMeriéux, Marcy-l'Étoile, France) automated system. Stenotrophomonas maltophilia was identified in 1.13% of blood cultures during the study period. Of the isolates, 58.6% were male (n=61), and the rest of them belonged to female patients. The mean age of the patients was 32.75 years, and the median age was 52.5 years. The department with the highest rate of isolates with 48.1% was the intensive care unit, followed by oncology (18.3%), other internal medicine (hematology, infection, nephrology) (16.3%), pediatrics (15.4%), and surgery (1.9%). The antibiotics for the antimicrobial susceptibility of Stenotrophomonas maltophilia isolates according to the EUCAST (v.13.1.) criteria are trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SXT) and cefiderocol, which is not yet available in Turkey. Trimethoprim-sulfamethoxazole is considered to be resistant when the minimum inhibitory concentration is >4 mg/L, and susceptible if  it’s ≤0.001 mg/L. In the disc diffusion test, if the zone diameter is <16 mm, it is resistant, and when it is ≥50 mm, it is considered to be susceptible, increased exposure. According to these clinical breakpoints, 99.04% of the isolates (n=103) were found to be resistant to TMP-SXT. One isolate was susceptible with increased exposure. The resistance rate varies between 29.7% and 96.3% worldwide, but it has been reported that the resistance rate has increased in recent years. Stenotrophomonas maltophilia bloodstream infections are difficult to manage due to the limited treatment options. The American Clinical and Laboratory Standards Institute (Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI, M100-Ed33:2023) recommends susceptibility testing for ticarcillin-clavulanate, ceftazidime, minocycline, levofloxacin and chloramphenicol together with TMP-SXT and cefiderocol in these infections. The results of our study showed that the resistance of Stenotrophomonas maltophilia isolates to TMP-SXT in blood cultures in our hospital was at an emerging level (99.04%), above the world average. The risk groups were consisted of patients hospitalized in the intensive care unit, oncology and hematology departments. Local data and multicenter surveillance studies are needed to better characterize the trend of agent-specific antimicrobial resistance at the local and national levels. The content of the antibiotic susceptibility test applied in Türkiye should be updated specifically for the agent in the light of local and national epidemiological data.

Keywords: S. maltophilia, non-fermenter Gram-negative bacillus, trimethoprim-sulfamethoxazole resistance, surveillance, nosocomial infection, bloodstream infection.